Le parcours du musée englobe le monde arabe dans ses dimensions culturelle, religieuse, sociale, et anthropologique. Il suit le fil d’une histoire, en abordant successivement cinq thèmes :
- Les Arabies,
- Sacré et figures du divin,
- Les villes arabes,
- La beauté et Le temps de vivre.
Un nouvel accrochage remet à l’honneur la création dans le monde arabe depuis la seconde moitié du XXe siècle, et la fait dialoguer avec les œuvres et les objets du passé.